肩膀两侧长红色痘痘被诊断为毛囊炎，治疗效果不佳，建议复诊调整治疗方案或进一步检查；在三甲医院长达一年半的多次 HIV 检测均为阴性，可彻底排除感染可能，自身免疫性疾病一般不影响检测结果，长期服用恩替卡韦治疗乙肝也通常不会对 HIV 检测产生影响，应放下心理负担，同时继续寻求治疗肩膀痘痘的方法。
艾滋病过了窗口期检测为阴性就可以完全排除感染的可能。以下是对您提出的问题的详细解 答：
1.关于肩膀两侧长红色痘痘的问题：从您的描述来看，三甲医院诊断为毛囊炎，但用药后效果不佳。毛囊炎是一种常见的皮肤疾病，可能由多种原因引起，如细菌感染、油脂分泌过多、毛囊堵塞等。如果治疗效果不理想，建议您可以考虑再次就诊，医生可能会根据具体情况调整治疗方案，或者进行进一步的检查以明确病因。
2.关于HIV检测的问题：您在三甲医院进行了长达一年半的多次检测，结果均为阴性。一般来说，艾滋病的窗口期为3个月左右，过了窗口期后检测结果为阴性就可以完全排除感染的可能。您已经检测了一年半且结果为阴性，所以可以彻底排除HIV感染，不必过于担心。
3.关于自身免疫性疾病是否会影响HIV检测的问题：通常情况下，自身免疫性疾病不会影响HIV检测的结果。HIV检测是针对艾滋病病毒的特异性检测，与自身免疫性疾病的机制不同。
4.关于长期服用恩替卡韦和乙肝的问题：恩替卡韦是治疗乙肝的常用药物，一般不会对HIV检测产生影响。
总之，您的HIV检测结果为阴性，已经可以排除感染的可能。对于肩膀上的红色痘痘，建议您继续寻求皮肤科医生的帮助，以确定合适的治疗方案。同时，也希望您能够放下心理负担，保持良好的心态和生活习惯。