肛门两侧长很多小疙瘩可能是尖锐湿疣、扁平湿疣、传染性软疣、湿疹或其他疾病引起，需要及时就医明确诊断。
肛门两侧长很多小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致，主要通过性接触传播。初期为散在或呈簇状增生的粉色或白色小乳头状疣，柔软，湿润，其后逐渐增大、增多，可融合成菜花状或鸡冠状增生物。
2.扁平湿疣：为二期梅毒的表现之一，主要发生于肛周、外生殖器等部位，表现为边缘清楚的扁平丘疹，表面潮湿而有光泽。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。
4.湿疹：多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可发生于肛门周围。表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂等多形性皮损，伴有瘙痒。
5.其他：如肛门尖锐湿疣、皮脂腺异位症、汗管瘤等也可出现肛门两侧长小疙瘩的情况。
总之，肛门两侧长很多小疙瘩的原因较多，可能是良性病变，也可能是恶性肿瘤。建议及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。