大便肛门疼的原因可能有以下几点：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。引起肛裂的原因主要是便秘或腹泻，以及肛管狭窄、肛门外伤等。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，便后可因肛门括约肌收缩而引起剧烈疼痛。外痔表面盖以皮肤，可以看见或摸到，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。
3.内痔：发生在肛管齿状线以上，内痔一般不痛，以便血、痔核脱出为主要症状，严重时会喷血、痔核脱出后不能自行还纳，需要用手推回。
4.肛管炎：肛管炎是长期的粪便刺激和不良的排便习惯引起的，其主要表现为肛门部下坠感、疼痛、肛管黏膜充血、水肿、糜烂，有时会出现脓性分泌物。
5.肛周脓肿：是指肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，其特点是自行破溃，或在手术切开引流后常形成肛瘘。肛周脓肿的症状是疼痛、肿胀、发热，有时会出现全身症状，如寒战、高热、乏力等。
6.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦部的炎症，常并发肛乳头炎，是肛门感染的常见疾病之一。肛窦炎的主要症状是肛门部不适和疼痛，有时会出现肛门瘙痒、下坠感等。
7.直肠癌：直肠癌是指从齿状线至直肠乙状结肠交界处之间的癌，是消化道最常见的恶性肿瘤之一。直肠癌的早期症状不明显，随着病情的发展，会出现排便习惯改变、血便、脓血便、里急后重、便秘、腹泻等症状，同时会伴有肛门疼痛、肛门下坠、肛门肿物等症状。
如果出现大便肛门疼的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。