睾丸隐隐作痛是否会自愈，取决于引起疼痛的原因。以下是一些可能的情况：
1.睾丸扭转：这是一种急症，需要立即就医。如果不及时治疗，睾丸可能会坏死。
2.附睾炎或睾丸炎：通常由细菌感染引起，需要使用抗生素治疗。如果治疗不彻底，可能会转为慢性炎症，导致疼痛持续。
3.精索静脉曲张：这是一种血管病变，可能导致睾丸血液循环不畅，引起疼痛。轻度精索静脉曲张可能会自行缓解，但严重的需要手术治疗。
4.其他原因：如睾丸损伤、前列腺炎、阴囊湿疹等，也可能引起睾丸疼痛。这些情况下，疼痛是否会自愈取决于具体病因和病情的严重程度。
需要注意的是，睾丸是男性重要的生殖器官，任何异常都应引起重视。如果出现睾丸隐隐作痛，建议及时就医，进行详细的检查，以确定病因，并采取相应的治疗措施。在等待就医期间，应注意休息，避免剧烈运动和长时间站立，不要自行用药，以免掩盖病情。