大脚趾甲发黑指甲变厚的原因可能是灰指甲、甲下淤血、甲母痣或其他疾病，如末梢循环障碍、心脏疾病、肺部疾病等，也可能是药物副作用所致。建议及时就医，明确诊断后进行相应治疗。
大脚趾甲发黑指甲变厚，可能是以下原因引起：
1.灰指甲：（1）由皮肤癣菌、酵母菌及非皮肤癣菌等真菌引起。（2）甲板或甲板下组织感染。（3）表现为甲颜色和形态异常。（4）多由手足癣直接传染，或由经常搔抓足癣、股癣，而后感染蔓延而引起。
2.甲下淤血：（1）多由挤压、碰撞等引起。（2）甲下淤血导致血液渗出，使甲板下形成黑斑。（3）随着趾甲的生长，黑斑会逐渐向趾甲远端移动。
3.甲母痣：（1）是痣的一种。（2）长在指甲上，表现为甲板黑线，宽度一致。（3）通常是良性的，但也有恶变的风险。
4.其他：（1）严重的末梢循环障碍、严重的心脏疾病、肺部疾病等也可能导致指甲变黑变厚。（2）某些药物的副作用也可能引起指甲改变。
如果大脚趾甲发黑指甲变厚，建议及时就医，明确诊断。如果是灰指甲，需要使用抗真菌药物治疗；如果是甲下淤血，一般不需要特殊处理，会随着趾甲的生长逐渐消退；如果是甲母痣，需要密切观察，如果出现颜色加深、宽度增加、疼痛等异常，应及时手术切除并做病理检查；如果是其他原因引起的，需要针对病因进行治疗。