麝香保心丸是常用的心血管药物，正常规范使用下副作用相对较少。但在个别情况下可能出现一些反应。
胃肠道方面
部分患者可能出现胃部不适，如轻度的胃部灼热感、隐痛等，这可能与药物中某些成分对胃肠道的刺激有关，一般症状较轻，不影响继续用药。
过敏反应
少数过敏体质者可能对麝香保心丸中的某些成分过敏，出现皮疹、瘙痒等过敏症状，此时应立即停药并就医。
神经系统
个别人可能出现头痛等神经系统症状，但发生概率较低。
特殊人群需谨慎
孕妇禁用麝香保心丸，因为其中某些成分可能对胎儿产生不良影响；老年人使用时需密切观察身体反应，因为老年人各器官功能有所减退，对药物的耐受性和反应可能与年轻人不同；有严重肝肾功能不全的患者使用时也需格外谨慎，应在医生指导下权衡利弊后决定是否使用，因为肝肾功能不全可能影响药物的代谢和排泄，增加不良反应发生的风险。