麝香保心丸的副作用相对较少见，但在某些特定情况或个体中可能出现一些反应。
胃肠道不适
部分患者服用后可能出现胃部不适，如轻度的恶心、胃部烧灼感等，这与药物中某些成分对胃肠道的刺激有关，一般症状较轻，多数人可耐受。
过敏反应
极少数患者可能对麝香保心丸中的某些成分过敏，表现为皮肤瘙痒、皮疹等过敏症状，此时应立即停药并就医。
特殊人群情况
对于孕妇等特殊人群，麝香保心丸可能存在一定风险，因为其成分可能对妊娠产生影响，孕妇应避免使用，需在医生严格评估下谨慎考虑是否用药。
与其他药物相互作用
若与其他药物同时使用，有可能发生药物相互作用，虽然这种情况相对少见，但也需引起重视，在联合用药时应告知医生正在服用的药物，以便医生判断是否存在潜在风险。