怀孕 50 天做阴超一般不会有严重危害，但可能存在一些相对较轻微的情况。
一、对孕妇心理的影响
部分孕妇可能会因对阴超操作有顾虑而产生紧张焦虑情绪，这可能会对孕妇的心理状态产生一定影响，但这种影响通常是短期的，可通过医护人员的解释沟通来缓解。
二、对阴道及宫颈的影响
一般规范操作下，阴超探头不会造成明显的阴道或宫颈损伤，但个别孕妇可能在检查后出现少量阴道少量出血情况，多能自行恢复。这是因为探头接触阴道内组织，可能会对局部黏膜有轻微刺激。
三、对胚胎的影响
正常情况下，规范的阴超检查不会对胚胎造成不良影响。目前有科学研究表明，在早期妊娠中合理进行阴超检查，其导致胚胎异常的风险极低，因为阴超的超声能量在安全范围内，不会对胚胎发育产生显著的不良作用。不过，对于有阴道出血、先兆流产等特殊病史的孕妇，操作时需更加轻柔谨慎。
四、个体差异导致的不同反应
不同孕妇对阴超检查的耐受程度不同。一些孕妇可能体质较为敏感，在检查后可能会有短暂的下腹坠胀感等不适，但大多会很快缓解。而对于既往有阴道炎症等情况的孕妇，检查过程中要严格遵循无菌操作，以降低感染风险，但只要操作规范，感染风险也可控制在很低水平。