对大豆过敏者
大豆卵磷脂提取自大豆，对大豆过敏的人群食用后可能引发过敏反应，如皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等严重的过敏症状，这类人群应避免摄入大豆卵磷脂。
正在服用特定药物者
某些药物可能与大豆卵磷脂发生相互作用，影响药物疗效或增加不良反应风险。例如正在服用抗凝血药物的人群，大豆卵磷脂可能干扰凝血功能，需谨慎使用。
甲状腺功能亢进患者
甲状腺功能亢进患者机体代谢处于亢奋状态，大豆卵磷脂的摄入可能会进一步加重代谢负担，不利于病情的控制，这类患者要权衡食用大豆卵磷脂的利弊。
胃肠道功能严重紊乱者
大豆卵磷脂可能会对胃肠道产生一定刺激，对于胃肠道功能严重紊乱，如患有严重胃炎、胃溃疡且处于急性发作期的人群，食用后可能加重胃肠道不适症状，如腹痛、腹泻等，应避免食用。