牙齿最里面的肉肿起来了，可能是由以下原因引起的：
1.智齿冠周炎：智齿是口腔内牙槽骨上最里面的第三颗磨牙，由于萌出空间不足，智齿可能无法完全长出，导致智齿周围的牙龈发炎、肿胀。
2.牙龈炎：不注意口腔卫生，食物残渣、细菌等在牙龈边缘堆积，可能会引起牙龈炎，导致牙龈红肿、疼痛。
3.牙周炎：牙周炎是侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由牙龈炎发展而来，逐渐加重会导致牙槽骨吸收、牙齿松动。
4.根尖周炎：当牙齿龋坏、牙髓炎等未得到及时治疗，可能会发展为根尖周炎，导致根尖周围组织发炎，从而引起牙龈肿胀。
5.其他：牙龈瘤、口腔肿瘤等也可能导致牙龈肿胀。
针对不同的原因，治疗方法也有所不同。以下是一些可能的治疗建议：
1.保持口腔卫生：每天早晚刷牙，使用牙线、漱口水等辅助清洁工具，定期洗牙。
2.药物治疗：可以在医生的指导下使用抗生素（如甲硝唑、阿莫西林等）、止痛药（如布洛芬、对乙酰氨基酚等）缓解症状。
3.局部治疗：针对病因进行治疗，如智齿冠周炎需要进行局部冲洗、上药；牙龈炎和牙周炎需要进行洁治、刮治等。
4.对因治疗：如果是牙齿本身的问题引起的，需要进行根管治疗、拔牙等。
5.手术治疗：如果牙龈肿胀严重，形成脓肿，可能需要进行手术切开引流。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据个人情况制定。如果牙龈肿胀持续不缓解或伴有其他症状，如发热、面部肿胀等，应及时就医，以免延误病情。此外，在治疗过程中，应避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重症状。