小肚子一阵一阵疼的原因有很多，可能是妇科疾病、外科疾病或内科疾病等，以下是一些可能的原因：
1.妇科疾病：
盆腔炎：女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症，可引起小肚子阵发性疼痛，多为双侧性，同时可伴有白带增多、月经失调等症状。
宫颈炎：子宫颈发生炎症，可导致小肚子疼痛，通常为下腹阵发性疼痛，伴有白带增多等症状。
子宫肌瘤：子宫肌瘤较大时，可引起下腹坠胀、疼痛，通常为阵发性，也可在性交或劳累后加重。
卵巢囊肿：卵巢囊肿蒂扭转或破裂时，可引起小肚子阵发性剧痛，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。
2.外科疾病：
肠痉挛：肠痉挛是由于肠壁平滑肌强烈收缩而引起的阵发性腹痛，疼痛部位多在脐周，呈阵发性发作，可伴有呕吐、腹泻等症状。
肠梗阻：肠道内容物不能正常运行或通过发生障碍时，会导致肠梗阻，引起小肚子阵发性疼痛，同时可能伴有呕吐、停止排气排便等症状。
阑尾炎：阑尾炎初期，可能表现为上腹部或脐周疼痛，数小时后转移并固定在右下腹，呈阵发性加剧，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。
3.内科疾病：
肠炎：肠道炎症可引起小肚子阵发性疼痛，同时可能伴有腹泻、恶心、呕吐等症状。
膀胱炎：膀胱炎可引起尿频、尿急、尿痛等症状，同时可能伴有小肚子阵发性疼痛。
前列腺炎：前列腺炎可引起下腹疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状，疼痛可放射至腰骶部、会阴部、耻骨上区等部位。
需要注意的是，小肚子一阵一阵疼的原因可能有很多，不同原因引起的疼痛可能伴有不同的症状。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，如高热、呕吐、腹泻、阴道出血等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，采取相应的治疗措施。