手指上长小水泡、痛痒的原因有以下几点：
1.汗疱疹：一种对称发生在手掌、足跖、指（趾）侧的水疱性皮肤病。病因尚不清楚，可能与过敏、感染、神经精神因素、遗传等有关。典型表现为手掌、手指侧面的小水疱，米粒大小，略高出皮肤表面，伴有瘙痒或烧灼感。水疱干涸后会出现蜕皮，有时会继发感染，出现脓疱、红肿、疼痛。汗疱疹一般在春末夏初开始发病，夏季加重，入冬后可自愈。汗疱疹可能会反复发作，影响生活质量。
2.手癣：由真菌感染引起的皮肤病，具有传染性。主要通过接触患者或患病动物的皮肤、毛发、鳞屑等而感染，也可由自身感染（如足癣）蔓延而来。手癣好发于手指间、掌心、手背、足跟、足侧缘等部位，表现为红斑、水疱、鳞屑、角化、皲裂等不同的症状，伴有瘙痒或疼痛。手癣的病情容易反复，冬季症状减轻，夏季加重。手癣需要及时治疗，否则可能会传染给他人或自身其他部位。
3.湿疹：一种由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，病因复杂，可能与过敏、感染、内分泌失调、精神紧张、遗传等有关。湿疹可以发生在任何部位，但多见于手、足、肘窝、腋窝、乳房、外阴、肛门等多汗、潮湿的部位。湿疹的表现多种多样，根据病程和临床表现可分为急性湿疹、亚急性湿疹和慢性湿疹。湿疹的症状主要有红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑、瘙痒等，可反复发作，迁延不愈。湿疹的治疗需要根据具体情况选择合适的方法，如外用药物（糖皮质激素、抗生素、抗组胺药等）、口服药物（抗组胺药、糖皮质激素、免疫抑制剂等）、物理治疗等。湿疹的预防也很重要，要注意保持皮肤清洁、干燥，避免接触过敏原，避免搔抓和烫洗皮肤，保持良好的心态和生活习惯。
4.接触性皮炎：皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应。病因主要有原发性刺激物和接触过敏原两种。原发性刺激物如强酸、强碱、芥子气、芥子油等，接触后可立即发病。接触过敏原如镍、铬、钴、某些金属制品、化妆品、洗涤剂、染发剂、农药、橡胶制品等，接触后需经过一定的潜伏期才发病。接触性皮炎的表现与接触物的性质、接触的时间、接触的方式有关，可分为急性接触性皮炎、亚急性接触性皮炎和慢性接触性皮炎。急性接触性皮炎表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂等，伴有瘙痒或疼痛。亚急性接触性皮炎表现为红斑、丘疹、鳞屑等，伴有轻度瘙痒。慢性接触性皮炎表现为皮肤增厚、粗糙、苔藓样变等，伴有瘙痒。接触性皮炎的治疗原则是去除病因，避免再接触致敏物或刺激物，根据病情选择合适的外用药物或口服药物。接触性皮炎的预防也很重要，要注意避免接触可疑的致敏物或刺激物，如化妆品、洗涤剂、染发剂、农药等，如必须接触，应做好防护措施。
5.其他：手指上长小水泡、痛痒还可能是其他原因引起的，如手足口病、寻常疣、扁平苔藓、系统性红斑狼疮等。这些疾病都有其特定的临床表现和诊断标准，需要专业医生根据具体情况进行判断和治疗。