直肠神经内分泌肿瘤的预后与肿瘤大小、具体部位、分级、分期等有关。分化差的G3级直肠神经内分泌肿瘤患者的生存期约10个月。分化好的G1、G2级直肠神经内分泌肿瘤的进展通常比较缓慢,生存期为3~20年。
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分级较低的直肠神经内分泌肿瘤,经过及时治疗,多数患者都可以根治,对身体也不会有明显的伤害。分级较高或转移到其他脏器的直肠神经内分泌肿瘤,会影响脏器功能,导致患者出现全身症状的概率增加。严重的直肠神经内分泌肿瘤,会危及患者生命。