直肠神经内分泌肿瘤的预后与肿瘤大小、具体部位、分级、分期等有关。分化差的G3级直肠神经内分泌肿瘤患者的生存期约10个月。分化好的G1、G2级直肠神经内分泌肿瘤的进展通常比较缓慢,生存期为3~20年。
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目前,直肠神经内分泌肿瘤的病因仍然不是十分明确,可能与社会环境、饮食习惯、遗传因素等有关。