扁桃体结石通常可以通过一些简单的方法尝试取出，但如果结石较大或反复出现，建议就医由医生处理。一般来说，自己在家可以先尝试用盐水漱口来辅助清理，比如用温盐水（大约半杯温水加半茶匙盐）每天漱口几次，可能有助于松动部分结石。
自行尝试清理的方法
使用棉签轻轻试探：可以在镜子的帮助下，用干净的棉签轻轻尝试触碰结石，看是否能将其推出，但要注意动作轻柔，避免损伤扁桃体。不过这种方法对于较深或较大的结石往往效果不佳。盐水漱口辅助：如前面所说，温盐水漱口能起到一定的清洁口腔和扁桃体隐窝的作用，有助于部分较小、松动的结石随漱口水流排出，但一般不能完全解决问题。
就医由医生处理的情况
医生用镊子夹取：当自行处理困难时，医生会在检查后，用专门的器械，如镊子等，在扁桃体局部消毒后，小心地将结石夹出。这种方法相对安全，但需要医生有一定的操作技巧。借助吸引器等设备：对于位置较深或较多的结石，医生可能会使用吸引器等设备来辅助取出，能更有效地清除结石。
日常预防扁桃体结石的方法
保持口腔清洁：每天至少刷牙2次，每次刷牙时间不少于3分钟，饭后也可以用清水或漱口水漱口，保持口腔内清洁，减少食物残渣在扁桃体隐窝内堆积，从而降低扁桃体结石形成的几率。规律作息与健康饮食：保持规律的作息，避免过度疲劳，同时注意饮食均衡，多吃蔬菜水果，少吃辛辣、油腻等刺激性食物，减少对扁桃体的刺激，也有助于预防扁桃体结石的产生。