急性肠炎的致病因素多样，病因不同用药也各异，因此不存在所谓治疗急性肠炎的最佳药物。患者有急性肠炎症状时，可遵医嘱用以下药物治疗：
一、抗生素药物：多数急性肠炎由细菌感染引起，患者可服用抗生素药物治疗。但服用前需进行药敏测试，而后依据药敏结果选择对应药物。一般来说，可遵医嘱服用阿莫西林、头孢曲松钠等。
1.阿莫西林：是一种广谱抗生素，能有效对抗多种细菌感染。
2.头孢曲松钠：对一些引起急性肠炎的细菌有较好的抑制作用。
二、抗病毒药物：部分急性肠炎由病毒感染导致，患者可遵医嘱服用阿昔洛韦、利巴韦林等抗病毒药物进行治疗。
1.阿昔洛韦：主要用于对抗特定病毒引起的感染。
2.利巴韦林：对相关病毒有抑制功效。
三、止泻药：急性肠炎常伴有腹泻症状，可遵医嘱服用止泻药来缓解，常用的有洛哌丁胺、复方苯乙哌啶等。
1.洛哌丁胺：能减少肠道蠕动，从而止泻。
2.复方苯乙哌啶：可改善腹泻情况。
四、益生菌药物：急性肠炎患者体内益生菌水平常会紊乱，此时可遵医嘱服用双歧杆菌三联活菌胶囊、乳酸菌素片来调理肠道菌群，也能缓解急性肠炎症状。
1.双歧杆菌三联活菌胶囊：有助于恢复肠道内正常菌群。
2.乳酸菌素片：可调节肠道微生态。
总之，急性肠炎患者应根据具体病因和症状，在医生指导下合理选择和使用药物进行治疗。