母乳性黄疸的发生与多种因素相关。一般认为，可能是母乳中的某些物质影响了宝宝肝脏对胆红素的代谢。有研究显示，母乳性黄疸约占母乳喂养新生儿黄疸的1% - 2%左右。
母乳成分相关因素
β-葡萄糖醛酸苷酶含量高：母乳中的β-葡萄糖醛酸苷酶含量相对较高，这种酶会使肠道内的结合胆红素又转化为未结合胆红素，而未结合胆红素会被肠道重新吸收进入血液，从而使得血液中胆红素水平升高，引发黄疸。脂肪酶影响：母乳中的脂肪酶可能也会对胆红素代谢产生一定作用，它会影响肠道对胆红素的处理过程，导致胆红素的肠肝循环增加，进而促使母乳性黄疸的发生。
宝宝自身代谢特点
肝酶系统不成熟：新生儿的肝脏酶系统发育尚不成熟，特别是UDP - 葡萄糖醛酸转移酶的活性较低，这就使得肝脏对胆红素的结合转化能力不足，不能及时将过多的未结合胆红素结合转化为结合胆红素排出体外，容易导致胆红素在体内积聚，引发母乳性黄疸。肠肝循环特点：新生儿的肠道相对较长，肠道内的菌群定植还不完善，肠道对胆红素的排泄和重吸收过程相对特殊。在母乳喂养的情况下，这种特殊的肠肝循环更容易让胆红素重新被吸收进入血液，使得胆红素水平持续升高，引发母乳性黄疸。
其他可能因素
遗传因素：有研究发现，部分母乳性黄疸的发生可能与遗传因素有关。如果宝宝存在某些与胆红素代谢相关的基因变异，就可能更容易出现母乳性黄疸的情况。不过，这种遗传因素导致的母乳性黄疸相对较为少见。喂养方式相关：如果母乳喂养不足，宝宝摄入的奶量较少，那么宝宝的排便就会减少，而排便减少会影响肠道内胆红素的排出，从而使得胆红素通过肠肝循环重新吸收进入血液的量增加，也会增加母乳性黄疸发生的风险。