三个月宝宝便秘的治疗方法包含养成排便习惯、改善饮食结构、使用益生菌或开塞露辅助排便、进行手术治疗等，具体应根据病因及个人情况选择合适方案，且要遵医嘱治疗。
一、养成排便习惯：三个月宝宝由于肌肉、神经等处于发育阶段，排便反射较弱，所以需要为其养成定时定期排便的良好习惯，这样有助于预防和改善便秘情况。
二、改善饮食结构：长期食用高蛋白质而少糖的食物易导致大便干结而引起宝宝便秘，这种情况下就要调整饮食结构。
三、药物辅助治疗：
1.若是奶量或辅食进食少，导致大便形成速度慢而出现便秘假象，且长期进食不足会影响身体正常发育进而影响排便功能。对此，通常可以适当服用肠道益生菌帮助消化，或直接使用开塞露缓解症状，但改善过程相对较长，因三个月宝宝属于特殊人群，务必遵医嘱用药，以免出现不良后果。
2.若宝宝便秘是由先天性巨结肠、先天性甲状腺功能低下等病理因素造成，可能需要根据患儿病情严重程度、年龄、全身状况等多种因素来选择相应的药物或手术治疗。
总之，三个月宝宝便秘的治疗不能急于求成，一定要做到对因对症治疗，切不可自行用药以免延误病情而导致严重后果。
关键点信息：三个月宝宝便秘治疗方法，包括养成排便习惯、改善饮食结构、药物辅助治疗（益生菌、开塞露）、手术治疗，需根据具体情况选择并遵医嘱，治疗不可求快。