三个月宝宝把尿存在诸多危害。首先，三个月的宝宝骨骼和肌肉发育尚未完善，把尿时若姿势不当，容易对宝宝的脊椎、髋关节等造成不良影响，可能影响其正常的生长发育。
影响脊柱发育：
三个月的宝宝脊柱还很柔软，处于发育阶段。把尿时如果家长没有把握好姿势，宝宝的脊柱无法得到良好的支撑，长期如此可能会导致脊柱变形。比如，不正确的把尿姿势可能会使脊柱的生理曲度发生改变，影响宝宝身体的正常形态发育。
破坏膀胱自主功能：
宝宝在三个月时，膀胱的自主控制能力还很弱，需要逐渐建立。如果过早进行把尿，会干扰宝宝膀胱自主感知充盈和排尿的过程，不利于膀胱自主功能的发育。正常情况下，宝宝的膀胱需要在不断充盈 - 排尿的过程中逐渐形成规律，但频繁把尿会打乱这个过程，导致宝宝膀胱功能发育延迟。
增加髋关节脱位风险：
三个月宝宝的髋关节还比较脆弱，把尿时如果姿势不对，比如把宝宝双腿强制分开成不自然的角度，会增加髋关节脱位的风险。因为此时宝宝的髋关节周围韧带等组织还没有发育成熟，不当的把尿动作容易对髋关节造成不良影响，可能影响宝宝未来的行走等运动功能。
引发心理不适：
频繁不恰当的把尿会让三个月的宝宝感到不适，可能会产生抵触情绪。宝宝无法用语言表达，但会通过哭闹等方式来抗议，长期下去可能会影响宝宝的心理情绪发展，不利于建立良好的亲子互动和宝宝的心理健康。