三个月宝宝有痰咳不出来，可能会导致呼吸不畅、影响睡眠和进食，严重的还可能引发肺炎等疾病。以下是一些建议：
1.多喝水：多喝水可以帮助稀释痰液，使其更容易咳出。
2.轻拍背部：在宝宝咳嗽时，家长可以用空心掌轻拍宝宝的背部，从下往上，从外向内，帮助宝宝咳出痰液。
3.调整体位：如果宝宝痰咳不出来，可以尝试让宝宝侧卧或俯卧，这样可以改变呼吸道的位置，有助于痰液排出。
4.保持空气湿润：可以使用加湿器增加空气湿度，缓解宝宝喉咙的不适。
5.就医治疗：如果宝宝的症状持续时间较长或伴有其他不适，如发热、呼吸急促等，建议及时就医。医生可能会根据宝宝的具体情况，开具祛痰药物或进行其他治疗。
需要注意的是，对于三个月的宝宝，家长在处理痰液问题时应格外小心，避免过度用力或使用不当的方法导致宝宝受伤。如果对宝宝的健康状况有任何疑虑，最好咨询医生的意见。