脑干出血多由高血压合并细小动脉硬化引起，约70%的脑干出血患者有高血压病史。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤破裂就易导致脑干出血。
高血压因素：
血压控制不佳：长期血压不稳定，比如血压长期处于160/100mmHg以上，就会增加脑干出血风险。高血压会使脑血管承受过大压力，血管壁受损，容易破裂出血。未规范治疗高血压：有些高血压患者不按时服药，或者自行增减药量，导致血压波动大，进而引发脑干出血。
血管病变因素：
脑内小动脉硬化：随着年龄增长，血管会逐渐老化，出现动脉硬化，这在50 - 60岁以上人群中更为常见。动脉硬化会使血管弹性下降，脆性增加，容易破裂。动脉瘤形成：除了高血压引起的微动脉瘤，先天性脑血管畸形等也可能导致动脉瘤，动脉瘤破裂时也容易引发脑干出血。
其他诱发因素：
情绪激动：突然的情绪激动，如暴怒、大喜等，会使血压急剧升高，从而诱发脑干出血。比如一些人在和别人激烈争吵后，就可能突发脑干出血。过度劳累：长期过度劳累，身体处于应激状态，会促使血压升高，增加脑干出血的可能性。像连续加班熬夜后，身体负担加重，血压波动，容易引发出血。剧烈运动：剧烈运动时，血压会快速上升，对于有血管基础病变的人来说，就容易导致脑干血管破裂出血。比如进行高强度的竞技运动后。