脑干出血通常是由高血压合并细小动脉硬化引起的，约占全部脑出血的10%~15%。长期高血压会使脑内小动脉形成微动脉瘤，当血压剧烈波动时，微动脉瘤破裂就容易导致脑干出血。
高血压因素
血压长期控制不佳： 血压持续高于正常范围，比如收缩压长期在140mmHg以上，舒张压长期在90mmHg以上，会不断损伤脑干部位的血管，增加脑干出血风险。据统计，有高血压病史且血压控制不理想的人群，脑干出血发生率比血压正常人群高很多倍。血压剧烈波动： 比如情绪突然激动、剧烈运动、用力排便等情况，会使血压在短时间内大幅升高，原本脆弱的脑干血管就可能承受不住而破裂出血。
血管病变因素
先天性血管畸形： 脑干部位存在先天性血管发育异常，像脑动静脉畸形等，血管结构异常，容易破裂出血。这种情况在年轻人中相对多见，虽然发生率不高，但一旦发生后果严重。淀粉样血管病： 多见于老年人，脑内血管的淀粉样物质沉积，会使血管壁弹性下降、脆性增加，容易破裂出血引发脑干出血。
其他危险因素
吸烟酗酒： 长期吸烟会损伤血管内皮，使血管变得狭窄、硬化，影响血液供应；过量饮酒会使血压升高，还会干扰凝血机制，增加脑干出血几率。有研究表明，长期吸烟酗酒的人患脑干出血的风险比不吸烟不喝酒的人高出2 - 3倍。过度劳累： 长期过度劳累、睡眠不足会使身体处于应激状态，交感神经兴奋，血压升高，进而增加脑干出血的可能性。