茯苓和茯神都来源于多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，但它们有明显区别。茯苓是整个菌核，而茯神是带有松根的茯苓。
来源与外观区别
茯苓来源： 茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，通常为类球形、椭圆形、扁圆形或不规则团块。茯神来源： 茯神则是茯苓菌核中间抱有松根的部分，形状多为方块状。
药性与功效侧重区别
茯苓药性与功效： 茯苓味甘、淡，性平，归心、肺、脾、肾经。具有利水渗湿、健脾、宁心的功效，常用于水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少、便溏泄泻、心神不安、惊悸失眠等病症。例如，在治疗脾虚引起的泄泻时，常与党参、白术等配伍使用。茯神药性与功效： 茯神味甘、淡，性平，归心经。相比茯苓，茯神更侧重于宁心安神，常用于心悸失眠、健忘等心神不宁的病症。比如，对于心气不足导致的心悸、失眠，茯神常与远志、酸枣仁等配伍。
临床应用区别
茯苓临床应用： 在临床中，茯苓应用较为广泛。比如治疗水肿，可与猪苓、泽泻等组成五苓散；治疗痰饮，常与半夏、陈皮等配伍成二陈汤加茯苓等。茯神临床应用： 茯神主要用于心神相关病症的治疗。像一些因情志不遂导致的心神不宁、失眠多梦，医生会根据情况选用茯神进行调理，常与朱砂等配伍，如茯神丸。