茯神与茯苓在提取部位、功效、治疗疾病方面存在区别。
一、提取部位不同：茯神即茯神木，是多孔菌科植物茯苓菌核中间抱有松根的白色部分；而茯苓是多孔菌科植物茯苓的干燥菌核，还可根据不同部位切制成茯苓块、茯苓片。
二、功效不同：茯神具有利水、安神、宁心的功效；茯苓具有宁心、利水渗湿、健脾的功效。
三、治疗疾病不同：茯神可用于治疗因心神不宁导致的健忘、失眠、胸闷、心慌、心悸、烦躁等不适症状；茯苓则用于治疗因脾胃虚弱引起的食欲减退、大便溏稀、心神不安、痰饮眩悸、脘腹胀满等症状，还可改善小便不利、下肢浮肿等情况。
总之，尽管这两种中药材都来自同一植物，但它们的功效和主治各异，所以在出现相关不适症状后，应经由中医师辨证，再选择相应的药物进行治疗。