直肠肛管周围脓肿的发病原因主要与肛腺感染、损伤、医源性因素、其他疾病有关。具体如下：
1.肛腺感染：肛腺开口于肛窦，肛窦容易发生感染，感染后可向肛腺管蔓延，形成肛腺炎，进而发展为肛周脓肿。
2.损伤：肛门周围皮肤裂伤、内痔注射、肛裂扩肛、直肠活检等，都可能导致肛管直肠损伤，细菌可由此进入肛腺，引起感染，形成肛周脓肿。
3.医源性因素：临床上，一些肛肠科手术，如痔切除术、肛瘘切开术等，如果手术过程中处理不当，或者术后护理不当，也可能导致感染，形成肛周脓肿。
4.其他疾病：一些全身性疾病，如糖尿病、白血病、艾滋病等，患者的抵抗力下降，容易发生感染，肛周脓肿也可能趁虚而入。此外，一些肛肠科疾病，如克罗恩病、溃疡性结肠炎等，也可能并发肛周脓肿。