非淋菌性尿道炎的治疗通常采用抗生素等药物。一般来说，常用的治疗药物有阿奇霉素、多西环素等。
药物治疗选择
阿奇霉素： 属于大环内酯类抗生素，对非淋菌性尿道炎的病原体有较好的抑制作用。一般单次口服一定剂量即可发挥疗效，但具体使用需遵循医嘱。多西环素： 是四环素类抗生素，能抑制病原体蛋白质合成从而起到杀菌作用。通常需要连续服用一段时间。
治疗中的注意事项
性伴侣同治： 非淋菌性尿道炎具有传染性，在治疗期间，患者的性伴侣也需要同时接受检查和治疗，以免发生交叉感染，导致病情反复。按时服药： 无论是使用哪种药物治疗，都要严格按照医生规定的剂量和疗程服用药物，不能随意增减药量或中途停药，否则可能影响治疗效果，还可能使病原体产生耐药性。
治愈标准及后续随访
治愈标准： 在完成治疗后，患者的症状完全消失，并且在治疗结束后的1 - 2周内进行复查，病原体检测呈阴性，才可视为临床治愈。定期随访： 即使患者经过治疗已经临床治愈，也建议在治愈后的1个月、3个月分别进行复查，以便及时发现可能出现的复发情况，一旦复发可及时调整治疗方案。
生活方式调整
多饮水： 患者每天应保证充足的饮水量，建议不少于1500 - 2000毫升，通过增加排尿次数来冲洗尿道，有助于减轻炎症反应，促进病情恢复。避免刺激性食物： 在治疗期间，要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、芥末等，同时也要避免饮酒，这些都可能会加重尿道的刺激症状，不利于病情的恢复。