长跖疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-1型等亚型。一般来说，当皮肤有破损，接触到HPV后就容易被感染从而长跖疣。
感染途径方面
直接接触感染： 比如直接接触了患有跖疣人群的患处，就有可能被传染。在公共浴室、游泳池等公共场所，因为接触到被病毒污染的地面、设施等，也有感染风险。据统计，在公共泳池环境中，感染HPV导致长跖疣的几率虽然不是很高，但确实存在一定可能性。间接接触感染： 使用了被HPV污染的物品，像毛巾、拖鞋等，也可能引发感染。如果自己脚上有微小伤口，接触到这些被污染的物品，病毒就有可乘之机侵入皮肤导致长跖疣。
自身因素影响
皮肤破损情况： 当脚部皮肤有微小破损时，比如走路磨出的小擦伤、皲裂等，这时候皮肤的防御屏障被破坏，HPV就更容易入侵并在局部细胞内繁殖，从而导致跖疣的形成。例如，长期行走、运动量大的人，脚部皮肤更容易出现微小破损，相对来说长跖疣的几率可能会比皮肤较完好的人高一些。免疫力状况： 人体免疫力较低时，对HPV的抵抗力也会下降，更容易受到HPV感染而长跖疣。比如患有某些慢性疾病、长期熬夜、过度劳累的人，免疫力会受到影响，就比较容易长跖疣。像一些癌症患者在放化疗后，免疫力低下，长跖疣的发生率会有所增加。
环境因素作用
潮湿环境： 脚部长期处于潮湿的环境中，比如穿不透气的鞋子，脚部出汗后不能及时蒸发，就会营造一个有利于HPV生存和繁殖的环境，增加长跖疣的可能性。研究发现，在湿度较高的环境里，HPV存活的时间相对更长，感染的风险也会相应提高。摩擦刺激： 脚部经常受到摩擦，比如鞋子不合适、长时间行走等，会不断刺激脚部皮肤，使皮肤更容易出现微小损伤，进而为HPV感染创造条件，导致跖疣发生。例如，长期穿挤脚的鞋子，脚部皮肤反复受到摩擦，长跖疣的几率就会比穿合适鞋子的人高。