长跖疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-1型等相关亚型。一般来说，当皮肤有破损，接触到HPV后就容易被感染从而长跖疣。
感染途径方面
直接接触传播： 比如直接接触了患有跖疣人群的患处，就有可能被感染。在公共浴室、游泳池等公共场所，因为接触到被病毒污染的地面、物品等，也有感染风险。据统计，在公共卫生条件较差的环境中，感染跖疣的几率会相对增高。间接接触传播： 使用了被HPV污染的毛巾、拖鞋等个人物品，也可能引发感染。例如，家里有人长了跖疣，共用毛巾后，健康人就可能被传染。
自身因素影响
皮肤破损： 当足部皮肤有微小破损时，比如走路磨出的小伤口、被锐器划伤等，HPV就更容易入侵。像长期穿不合适鞋子导致脚部反复摩擦受伤，就增加了长跖疣的可能性。免疫力低下： 当人体免疫力较弱时，比如患有某些疾病导致免疫力下降，或者长期熬夜、过度劳累等使身体抵抗力降低，此时对HPV的抵御能力变弱，就更容易感染长跖疣。比如长期熬夜的人，相比作息规律的人，感染跖疣的概率要高约20%。
易发人群特点
青少年和儿童： 这个年龄段的人群皮肤相对娇嫩，而且活动范围广，接触外界环境的机会多，同时自身免疫力相对还在发育中，所以更容易感染HPV长跖疣。足部多汗者： 足部容易出汗的人，脚部环境潮湿，这种环境有利于HPV的存活和感染，所以足部多汗的人长跖疣的几率比足部干爽的人要高。比如有研究发现，足部多汗者长跖疣的发生率比非多汗者高30%左右。经常赤脚的人： 像在沙滩、公共浴室等场所经常赤脚的人，直接与地面等接触，增加了接触HPV的机会，从而更容易长跖疣。