长跖疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 1、HPV - 2等亚型。一般来说，当皮肤有微小破损时，接触到HPV就容易被感染从而长跖疣。
感染途径方面
直接接触感染： 如果直接接触了长有跖疣患者的患处，就有可能被传染。比如在公共浴室、游泳池等公共场所，与患者共用拖鞋、毛巾等个人物品，就增加了感染HPV的风险。间接接触感染： 接触被患者污染的物品，也可能引发感染。像被HPV污染的地面、衣物等，健康人接触后，若皮肤有破损，病毒就会趁机侵入。
自身因素影响
皮肤破损： 当脚部皮肤有微小的擦伤、刺伤等破损时，HPV更容易入侵。比如长时间走路摩擦导致皮肤细微破损，或者不小心被尖锐物体划伤等情况，都为HPV感染创造了条件。免疫力低下： 自身免疫力较差的人，对HPV的抵抗力较弱，更容易感染长跖疣。例如患有某些慢性疾病、长期熬夜、过度劳累等导致身体免疫力下降的人群，比免疫力正常的人更易长跖疣。
足部环境因素
多汗： 脚部容易出汗的人，局部环境潮湿，这种环境有利于HPV的存活和繁殖。汗液会使皮肤处于湿润状态，为病毒提供了适宜的生存环境，增加了长跖疣的可能性。摩擦受压： 足部长期受到摩擦和压迫，比如穿不合适的鞋子，长时间行走、跑步等，会使足部皮肤经常处于受力状态，容易出现微小损伤，进而增加感染HPV长跖疣的几率。