直肠内粘膜脱垂的治疗方法需根据病情严重程度等因素来定。一般来说，轻度的直肠内粘膜脱垂可以通过保守治疗等方式，而中重度可能需要手术治疗。
保守治疗为主的情况
一般生活调理：
饮食调整： 要多吃富含膳食纤维的食物，像蔬菜（如芹菜、菠菜等）、水果（香蕉、苹果等），每天保证摄入足够的膳食纤维，一般建议成人每天膳食纤维摄入量在25~35克左右，这样能保持大便通畅，减少排便时对直肠粘膜的压力。排便习惯培养： 养成良好的排便习惯，每天定时排便，尽量缩短排便时间，最好控制在5分钟以内，避免长时间蹲厕。
药物辅助：
中药调理： 一些中药方剂可能对直肠内粘膜脱垂有一定缓解作用，比如补中益气汤加减等，不过需要在中医的辨证论治下使用。局部用药： 可以使用一些保护直肠粘膜的栓剂，如复方角菜酸酯栓等，能在一定程度上减轻直肠粘膜的刺激和炎症。
手术治疗情况
吻合器痔上粘膜环切术（PPH）：
适用情况： 对于中度至重度的直肠内粘膜脱垂，PPH是一种常用的手术方法。它是通过吻合器环形切除直肠下端的部分粘膜和粘膜下组织，使脱垂的粘膜向上悬吊复位。术后恢复： 一般术后住院时间较短，大约3~5天，术后需要注意休息，避免剧烈运动，按照医生要求进行伤口护理等。
直肠粘膜折叠术：
手术原理： 该手术是将脱垂的直肠粘膜进行折叠缝合，缩小直肠直径，增加直肠的支撑力，从而治疗直肠内粘膜脱垂。手术风险： 手术有一定的出血、感染等风险，但总体来说，对于合适的患者效果较好，术后需要密切观察有无出血、排便异常等情况。
其他治疗方式
硬化剂注射治疗：
注射药物选择： 常用的硬化剂有5%苯酚植物油等。注射方法： 将硬化剂注射到直肠粘膜下，使粘膜与肌层发生粘连固定，从而治疗直肠内粘膜脱垂。不过这种方法有一定的复发风险，而且要注意注射剂量和部位，避免出现严重并发症，如直肠狭窄等。