尿路感染主要是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的。大约95%的尿路感染是由单一细菌引起的，其中最常见的是大肠埃希菌，约占尿路感染病原菌的80% - 90%。
致病菌入侵途径
上行感染： 这是最主要的感染途径。细菌从尿道口进入，沿着尿道向上蔓延至膀胱、输尿管甚至肾脏。比如女性的尿道短而直，长度约3 - 5厘米，且靠近肛门，肠道中的细菌更容易侵入尿道，所以女性尿路感染的发生率比男性高很多。血行感染： 细菌从身体其他部位的感染灶进入血液，然后随血液循环到达泌尿系统引发感染。这种情况相对较少见，通常见于患有严重感染性疾病，如败血症等的患者，细菌通过血液传播到肾脏等部位引起感染。淋巴道感染： 盆腔和腹腔的感染可通过淋巴管进入泌尿系统，但这种情况极为罕见。
易感人群特点
女性： 除了尿道短的因素外，女性在经期、性生活后等情况，局部抵抗力下降，更容易让细菌滋生。比如经期卫生不良，使用不洁净的卫生用品，就会增加尿路感染的风险。另外，绝经后的女性由于雌激素水平降低，尿道黏膜变薄，也容易发生尿路感染。泌尿系统结构异常者： 比如患有尿路结石、先天性尿路畸形等疾病的人，尿液排出不畅，细菌容易在局部繁殖，从而引发尿路感染。像尿路结石患者，结石会阻碍尿液的正常流动，使尿液在局部积聚，为细菌的生长提供了良好的环境。免疫力低下者： 糖尿病患者由于血糖高，有利于细菌生长繁殖；长期使用免疫抑制剂的人，如器官移植后服用免疫抑制剂的患者，自身免疫力下降，容易受到细菌侵袭引发尿路感染。例如，糖尿病患者如果血糖控制不佳，尿糖含量高，就为细菌提供了丰富的营养，容易发生尿路感染。
不良生活习惯影响
饮水过少： 每天饮水量少于1500毫升，尿液生成减少，尿液对尿道的冲刷作用减弱，细菌就容易在尿路滋生。比如有些人工作忙起来就很少喝水，长时间不排尿，尿液中的细菌浓度升高，增加了尿路感染的可能性。不注意个人卫生： 不经常清洗外阴，尤其是女性，肛门周围的细菌容易污染尿道口。另外，不勤换内裤，也会让细菌在局部繁殖，进而引发尿路感染。比如内裤长时间不换，会残留汗液、分泌物等，为细菌生长创造条件。过度清洁： 虽然要注意个人卫生，但过度清洁也不好。比如频繁使用洗液冲洗阴道，会破坏阴道的正常菌群平衡，导致局部抵抗力下降，细菌容易逆行感染尿道引发尿路感染。