男性尿路感染通常是由多种因素引起的。一般来说，细菌感染是导致男性尿路感染的常见原因，其中大约80%的尿路感染是由大肠埃希菌引起的。
细菌入侵途径
上行感染：这是最主要的感染途径，细菌由尿道上行进入膀胱、输尿管甚至肾脏。比如，不注意尿道口的清洁卫生，细菌就容易沿着尿道往上走。男性如果有包茎或者包皮过长的情况，也会增加细菌滋生进而上行感染的风险。血行感染：这种情况相对较少见，是细菌通过血液循环到达肾脏和尿路其他部位引起感染。例如，身体其他部位有感染病灶，像皮肤感染、肺炎等，细菌随着血液流动到达尿路引发感染。
自身易感因素
尿路梗阻：如果男性存在尿路结石、前列腺增生等问题，就会导致尿路梗阻。尿液排出不畅，细菌容易在局部繁殖，从而引发尿路感染。据统计，大约50%的尿路梗阻患者会发生尿路感染。机体免疫力低下：当男性患有糖尿病、艾滋病等疾病时，机体免疫力下降，容易受到细菌侵袭引发尿路感染。另外，长期使用免疫抑制剂的男性，也处于相对免疫低下的状态，增加了尿路感染的发生几率。
生活习惯因素
不注意饮水：如果男性每天饮水量过少，尿液不能正常冲刷尿道，细菌就容易在尿道滋生。建议男性每天至少饮用1500 - 2000毫升的水，保持尿液的正常量和流速，有助于预防尿路感染。不良卫生习惯：不经常清洗会阴部，尤其是包皮过长的男性，包皮内容易藏污纳垢，细菌容易繁殖，进而引发尿路感染。还有不勤换内裤等不良卫生习惯，都可能增加尿路感染的发生风险。