胎儿停育的原因有多种。据统计，约50%-60%的早期胚胎停育是由于染色体异常导致的。
染色体因素
胚胎自身染色体异常： 受精卵在形成过程中，染色体发生了数目或结构的异常，这是最常见的导致胎儿停育的原因之一。比如三体综合征等情况，胚胎染色体异常无法正常发育，就容易出现停育。父母染色体异常： 如果父母一方或双方的染色体存在异常，也可能遗传给胎儿，影响胎儿正常发育，增加胎儿停育的风险。
母体因素
内分泌失调： 女性体内的激素水平对维持妊娠至关重要。例如，黄体功能不全时，孕激素分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，容易导致胎儿停育。一般来说，孕激素水平低于一定数值时，就可能增加胎儿停育风险。甲状腺功能异常也会有影响，甲状腺功能减退或亢进都可能干扰胚胎的正常发育进程。子宫异常： 子宫是孕育胎儿的场所，如果子宫存在畸形，如纵隔子宫等，会影响胚胎的着床和生长空间；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会影响子宫内环境，阻碍胎儿正常发育，增加胎儿停育几率。
免疫因素
自身免疫异常： 母体自身产生的一些抗体可能攻击胚胎，导致免疫排斥反应。比如抗磷脂抗体综合征，体内存在的抗磷脂抗体可引起胎盘血管血栓形成，影响胎盘供血，进而导致胎儿停育。同种免疫异常： 母体对胎儿的免疫耐受不足，也会引发免疫攻击，使得胎儿无法在母体内正常存活，导致停育发生。
环境因素
化学物质接触： 孕妇长时间接触一些有毒有害的化学物质，像苯、甲醛等，这些物质可能会影响胚胎的正常发育，增加胎儿停育的可能性。例如在甲醛超标的环境中工作或生活一段时间后，胎儿停育的风险会升高。辐射影响： 孕妇受到过量的辐射，如长期接触X射线等，辐射可能会破坏胚胎的细胞结构和遗传物质，导致胎儿停育。一般从事放射相关工作的孕妇，如果防护不当，就面临较高的胎儿停育风险。