尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见病原体有大肠杆菌等，大约50%的尿道炎是由大肠杆菌导致的。
病原体感染原因
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它常存在于肠道中，当机体抵抗力下降或尿道黏膜有损伤时，就容易侵入尿道引发感染。比如女性尿道短而宽，距离肛门较近，更容易被肠道细菌污染而感染尿道炎。另外，金黄色葡萄球菌、链球菌等也可能引起尿道炎。支原体、衣原体感染： 这主要通过性接触传播。比如沙眼衣原体、解脲脲原体等感染尿道后，会引起尿道炎症反应，出现尿频、尿急、尿痛等症状。
尿道局部因素
尿道梗阻： 如尿道结石、狭窄、前列腺增生等，会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内潴留，为病原体生长繁殖提供了有利条件，从而容易引发尿道炎。例如尿道结石患者，结石会阻碍尿液正常通过，使局部尿道黏膜受到刺激和损伤，增加感染尿道炎的风险。尿道损伤： 性生活时过于粗暴、外伤等都可能造成尿道黏膜损伤，使得病原体容易侵入尿道引发炎症。比如骑跨伤可能会导致尿道局部损伤，进而引发尿道炎。
机体免疫功能低下
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖水平较高，有利于细菌生长繁殖，而且机体的免疫功能会受到影响，抵抗力下降，容易发生尿道炎，并且病情相对更难控制，容易反复发作。据统计，糖尿病患者发生泌尿系统感染包括尿道炎的几率比正常人高很多。长期应用免疫抑制剂者： 像器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，其机体的免疫防御功能被抑制，对病原体的抵御能力减弱，容易受到各种病原体侵袭，引发尿道炎等感染性疾病。