尿道炎通常是由病原体感染引起的，其中约90%的尿道炎是由革兰阴性菌感染所致，常见的病原体有大肠杆菌等。
病原体感染因素
细菌感染： 大肠杆菌是引起尿道炎最常见的细菌之一，它容易在尿道定植从而引发感染。比如女性由于尿道较短且靠近肛门，大肠杆菌更易侵入尿道导致尿道炎。另外，葡萄球菌等细菌也可能引发尿道炎，当身体抵抗力下降时，这些细菌就有机会感染尿道。支原体、衣原体感染： 解脲支原体、沙眼衣原体等也可导致尿道炎。性接触是它们传播的主要途径，年轻人如果有不洁性生活史，就比较容易感染支原体、衣原体而引发尿道炎。
不良生活习惯因素
个人卫生不佳： 不注意私处清洁，尤其是女性，会阴部位容易滋生细菌，如果不及时清洗，就会增加尿道炎的发病风险。比如长时间不更换内裤，尿液、分泌物等残留会为细菌滋生创造条件。憋尿： 长时间憋尿会使尿液在膀胱内停留时间过长，尿液中的细菌容易繁殖，进而逆行感染尿道引发尿道炎。一般建议不要超过2小时憋尿，有尿意就应及时排尿。
其他因素
尿道损伤： 尿道器械检查等操作可能会损伤尿道黏膜，使细菌更容易侵入引发感染。例如做尿道镜检查后，如果没有做好护理，就可能导致尿道炎发生。糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖较高，尿液中含糖量也高，有利于细菌生长繁殖，所以糖尿病患者发生尿道炎的概率比正常人高。这类患者需要积极控制血糖，同时注意尿道卫生来降低尿道炎的发病风险。