咳嗽后脑勺疼可能由多种原因引起，比如剧烈咳嗽时，头部血压瞬间变化可能导致后脑勺疼，一般剧烈咳嗽持续几分钟到十几分钟后可能出现这种情况。
一、咳嗽导致颅内压变化引起
咳嗽引发颅内压波动： 当人剧烈咳嗽时，胸腔内压力急剧升高，进而影响到颅内压力。正常情况下颅内压力相对稳定，剧烈咳嗽使得这种平衡被打破，颅内压出现短暂波动，可能刺激到后脑勺部位的神经，从而引起疼痛。一般剧烈咳嗽持续10秒以上就较容易引发这种颅内压变化相关的后脑勺疼。呼吸道感染引发咳嗽连带头痛： 像感冒引起的呼吸道感染，病毒或细菌侵袭人体后，会导致呼吸道黏膜发炎，刺激咳嗽反射。同时，身体的炎症反应可能会释放一些炎性介质，这些介质可能会影响头部神经，尤其是后脑勺部位的神经，从而引发疼痛。感冒引起的咳嗽，病程一般在7 - 10天左右，在此期间可能会反复出现咳嗽后脑勺疼的情况。
二、颈部肌肉紧张相关因素
咳嗽时颈部肌肉过度收缩： 咳嗽的时候，颈部的肌肉会不自主地过度收缩来配合呼吸等动作。长时间剧烈咳嗽会让颈部肌肉一直处于紧张状态，时间久了就可能牵扯到后脑勺部位的肌肉，导致疼痛。如果咳嗽持续半小时以上，颈部肌肉紧张的情况就比较明显，后脑勺疼的可能性也会增加。原有颈部问题诱发： 本身有颈椎病等颈部疾病的人，咳嗽时颈部的活动和压力变化更容易刺激到颈椎相关神经，进而放射到后脑勺引起疼痛。有颈椎病病史的人，比如已经确诊颈椎间盘突出症的患者，咳嗽时发生后脑勺疼的概率比正常人高很多。
三、血管因素导致
咳嗽引起血管痉挛： 剧烈咳嗽可能会影响脑部血管的正常收缩和舒张功能，导致血管痉挛。后脑勺部位的血管如果发生痉挛，就会引起疼痛。一般剧烈咳嗽后几分钟内，如果出现血管痉挛，就可能马上感觉到后脑勺疼。血压波动相关： 咳嗽时血压会有波动，对于一些血压原本就不太稳定的人来说，这种波动可能更明显。血压的波动可能会影响后脑勺部位的血液循环，从而引发疼痛。有高血压病史的人，在咳嗽时出现后脑勺疼的情况相对常见，尤其是血压控制不佳时。