引起睡觉起来腰疼后背疼的原因有很多，常见的有以下几种：
1.床垫不合适：床垫过软或过硬，都会影响脊柱的正常生理曲度，导致腰部和背部的肌肉紧张和疼痛。
2.睡眠姿势不正确：睡觉时姿势不良，如蜷缩、侧卧或仰卧时手臂放在头上，会导致腰部和背部的肌肉过度拉伸或压迫，引起疼痛。
3.腰部和背部肌肉劳损：长时间保持同一姿势或进行重体力劳动，会导致腰部和背部肌肉疲劳和劳损，引起疼痛。
4.脊柱病变：如脊柱侧弯、椎间盘突出、脊柱炎等，会导致腰部和背部的疼痛。
5.妇科疾病：女性患有盆腔炎、宫颈炎等妇科疾病时，炎症可刺激腰部和背部的神经，引起疼痛。
6.泌尿系统疾病：如肾炎、肾盂肾炎、肾结石等，会导致腰部和背部的疼痛。
7.其他：如感冒、流感等疾病，也会引起腰部和背部的疼痛。
如果睡觉起来腰疼后背疼的症状持续时间较长或伴有其他症状，如发热、尿频、尿急、尿痛等，建议及时就医，明确病因，进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应注意保持良好的睡眠姿势，选择合适的床垫，避免长时间保持同一姿势或进行重体力劳动，注意腰部和背部的保暖。