肥厚型梗阻性心肌病常见症状有劳力性呼吸困难，约80%的患者在劳累后会出现呼吸不畅的情况，这是因为运动时心脏负荷增加，而该病患者的心脏舒张功能受限，导致肺部淤血加重。
一、胸痛表现
运动相关胸痛： 约60%的患者会出现胸痛症状，多在运动时发作，疼痛性质不一，可为压榨性、闷痛等。这是由于心肌肥厚使心肌耗氧量增加，而冠状动脉供血相对不足，导致心肌缺血缺氧引发胸痛。非运动性胸痛： 部分患者也可能在休息时出现胸痛，机制较为复杂，可能与心肌肥厚导致的心肌顺应性下降、心室舒张末期压力增高等因素有关。
二、晕厥情况
运动中或运动后晕厥： 约1/3的患者会发生晕厥，一般在运动时或运动后即刻出现。这是因为肥厚的心肌使左心室流出道梗阻，导致心输出量突然减少，脑供血不足而引发晕厥。例如在剧烈运动时，心脏需要更大的输出量来满足身体需求，但梗阻的存在限制了输出量，进而造成脑部缺血缺氧导致晕厥。静止时晕厥： 少数患者可能在静止状态下发生晕厥，原因可能是心律失常等因素影响了心脏的正常射血功能。
三、心悸症状
心律失常引起的心悸： 患者常可感觉到心跳异常，这是因为肥厚型梗阻性心肌病容易合并心律失常，如室性早搏、心房颤动等。心律失常时，心跳的节律或频率发生改变，患者就会主观感觉到心悸。例如合并心房颤动时，心房失去有效的收缩，心跳节律紊乱，患者会明显感到心慌不适。