子宫畸形主要是胚胎发育时期出现异常导致的。在胚胎发育的第6 - 10周，女性生殖系统由原始生殖嵴分化而来，若在此期间受到某些因素干扰，就可能引发子宫畸形。
遗传因素导致
染色体异常：部分子宫畸形与染色体异常相关，比如特纳综合征等染色体疾病，会影响生殖系统的正常发育，进而增加子宫畸形的发生风险。研究发现，染色体数目或结构的异常可能干扰胚胎期生殖器官的正常分化过程。家族遗传倾向：如果家族中有子宫畸形的病例，那么后代发生子宫畸形的概率相对会高一些。虽然具体的遗传机制还在研究中，但家族遗传因素是需要考虑的一个方面。
胚胎发育环境因素影响
母体用药不当：在胚胎发育早期，孕妇如果服用了某些致畸药物，可能会影响子宫的正常发育。例如，孕期使用了一些影响细胞分化和器官形成的药物，就可能干扰子宫的形态构建。接触有害物质：孕妇在孕期接触了放射性物质、化学毒物等有害物质，也可能导致子宫畸形。像长期处于含有苯、甲醛等有毒化学物质的环境中，会对胚胎发育产生不良影响，进而引发子宫畸形。
内分泌因素作用
激素水平失衡：在胚胎发育期间，女性体内的性激素水平对生殖器官的发育至关重要。如果雌激素、孕激素等激素分泌异常或比例失调，就可能影响子宫的正常分化。比如，雌激素水平过低可能无法满足子宫正常发育所需的信号传导，从而导致子宫畸形。内分泌疾病影响：孕妇患有某些内分泌疾病，如糖尿病等，也可能波及子宫的发育。糖尿病孕妇血糖控制不佳时，会影响胚胎的代谢环境，进而干扰子宫的形态形成，增加子宫畸形的发生几率。