腰间盘突出导致腰痛主要是因为腰椎间盘的退变、损伤等因素，使得椎间盘的髓核突出，刺激或压迫周围的神经组织等。一般来说，腰间盘突出引发腰痛时，其发病机制与椎间盘的病理变化密切相关。
突出的病理变化影响
椎间盘退变： 随着年龄增长，通常30岁以后椎间盘开始逐渐退变，水分减少，弹性下降，更容易发生突出。当椎间盘退变后，其承受压力的能力减弱，在外力作用下就容易向后突出。损伤因素： 长期弯腰劳作、久坐、腰部急性扭伤等都可能诱发腰间盘突出。比如长时间坐着工作的人，腰椎处于前屈位，椎间盘所受压力较大，长期如此就增加了腰间盘突出的风险。当腰间盘突出后，突出的部分会刺激周围的神经组织，引发炎症反应，从而导致腰痛。
对神经的刺激情况
神经根受压： 腰间盘突出若压迫到神经根，会引起神经根的水肿和炎症。以腰4 - 5、腰5 - 骶1椎间盘突出较为常见，压迫相应神经根时，会导致神经支配区域出现疼痛，疼痛可放射到臀部、下肢等部位，同时腰部本身也会因神经受刺激而产生疼痛。马尾神经受影响： 严重的腰间盘突出可能压迫马尾神经，除了会引起腰痛外，还可能出现大小便功能障碍等严重问题，但这种情况相对较少见。
腰部肌肉的反应
肌肉保护性痉挛： 腰间盘突出引发腰痛时，腰部肌肉会出现保护性痉挛。为了减轻突出椎间盘对神经的刺激，肌肉会不自主地收缩，长时间的肌肉痉挛会进一步加重腰部的疼痛，并且影响腰部的活动功能，导致患者弯腰、转身等动作受限。肌肉劳损加重： 由于腰痛导致患者腰部活动减少，肌肉长期处于相对静止状态，会逐渐出现劳损，而肌肉劳损又会反过来加重腰痛，形成一个恶性循环。