胃功能紊乱的症状多样，常见的有消化不良，约有30% - 50%的胃功能紊乱患者会出现餐后饱胀感，感觉吃一点东西就觉得肚子很胀，长时间不消化。
消化系统症状
腹痛： 大约20% - 50%的胃功能紊乱患者会有腹痛症状，疼痛位置不固定，可能在上腹部，疼痛性质多样，有的是隐痛，有的是胀痛等。一般在进食后可能会加重，但也有部分人进食后疼痛缓解。反酸、烧心： 近30%的患者会出现反酸现象，感觉有酸水从胃里涌到口腔，同时可能伴有烧心感，就是胸骨后有灼热样的不适，尤其在平卧、弯腰或腹压增高时更容易出现。
全身症状
精神神经症状： 约40% - 60%的胃功能紊乱患者会有精神神经方面的表现，比如容易焦虑、抑郁，还可能出现头晕、头痛等症状。有些患者会因为胃部不适而影响睡眠，大约有30% - 40%的患者存在睡眠障碍，表现为入睡困难、多梦、易醒等。
其他表现
食欲变化： 部分患者会出现食欲减退的情况，食量比平常明显减少；但也有少数患者会出现食欲亢进，总是感觉很饿，想吃东西。而且患者的体重可能会因为食欲变化而有所波动，如果是长期食欲减退的患者，体重可能会逐渐下降，下降幅度因人而异，有的可能1 - 3个月内体重下降3 - 5公斤。