胃肠感冒通常可以使用对症治疗的药物来缓解症状，一般来说，常用的药物有缓解腹泻的蒙脱石散等，以及缓解发热、头痛的对乙酰氨基酚等。
缓解症状类药物
止泻药物：如果胃肠感冒出现腹泻症状，蒙脱石散是常用的止泻药，它可以吸附肠道内的毒素和病菌，保护肠道黏膜，一般成人每次服用1袋（3克），每天3次。退热止痛药物：当胃肠感冒伴有发热、头痛等症状时，对乙酰氨基酚可用于退热止痛，它能抑制前列腺素的合成，从而发挥解热镇痛作用，成人一次服用0.3 - 0.6克，每4 - 6小时可重复用药一次，24小时内不超过2克。
调节胃肠道功能类药物
益生菌类：肠道益生菌如双歧杆菌四联活菌片等，有助于调节胃肠道菌群平衡，改善胃肠功能紊乱的情况。一般成人一次服用2 - 3片，一天3次，用温水送服。不过，2岁以下幼儿服用时需咨询医生，因为幼儿的肠道菌群调节需要特别注意。胃黏膜保护剂：像铝碳酸镁咀嚼片，能保护胃黏膜，减轻胃肠感冒引起的胃部不适，成人一次1 - 2片，一天3 - 4次，在饭后1 - 2小时或睡前服用。但孕妇及严重肾功能不全者要慎用，需在医生指导下使用。
抗病毒类药物
中成药：一些中成药也可用于胃肠感冒的治疗，比如藿香正气软胶囊，它具有解表化湿、理气和中的作用，对于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的胃肠感冒有一定疗效。成人一次2 - 4粒，一天2次。不过，对酒精过敏者要禁用藿香正气软胶囊，因为其中含有乙醇成分。西药抗病毒：如果是由病毒感染引起的胃肠感冒，在医生评估后，对于一些特定人群可能会使用利巴韦林等抗病毒药物，但利巴韦林对儿童的副作用需要谨慎考虑，一般不建议儿童随意使用，且使用时要严格遵循医生的医嘱。