早晨起来腰酸疼可能由多种原因引起，比如床垫不合适，一般来说，使用10年以上的床垫就可能影响睡眠时的脊柱支撑，导致晨起腰酸。
常见原因分析
肌肉劳损方面
长期不良姿势： 如果白天长时间久坐、久站或者保持弯腰等不良姿势，像办公室职员长时间坐着对着电脑工作，到了早晨就容易出现腰酸疼。因为肌肉长时间处于紧张状态，晨起时血液循环还未完全恢复，就会感觉腰酸。运动过量： 前一天进行了剧烈运动，比如长跑、高强度的力量训练等，肌肉会产生乳酸堆积，早晨起来就可能出现腰酸疼的情况。尤其是平时很少运动突然进行大量运动的人，这种现象更明显。
脊柱问题导致
腰椎间盘突出： 椎间盘退变、损伤等因素可能引发腰椎间盘突出，当压迫到周围神经时，早晨起床后可能会感觉到腰酸疼，有的还可能伴有下肢的麻木、疼痛等症状。一般多见于长期从事重体力劳动或者腰部曾受过伤的人群。腰椎骨质增生： 随着年龄增长，腰椎会出现骨质增生，这是一种退行性改变。早晨起来时，腰部肌肉相对僵硬，增生的骨质可能会刺激周围组织，导致腰酸疼，活动后症状可能会有所缓解，但活动过多又会加重。
肾脏疾病影响
肾炎： 肾炎患者早晨起来可能会有腰酸疼的表现，同时还可能伴有水肿（尤其是眼睑、面部水肿）、高血压等症状。比如慢性肾小球肾炎，病情发展过程中就可能出现晨起腰酸疼的情况。肾结石： 肾结石患者也可能出现晨起腰酸疼，疼痛可能比较剧烈，还可能伴有血尿等症状。当结石在肾脏内移动时，会刺激肾脏黏膜，导致腰酸疼，而且疼痛可能会向腹部放射。
妇科疾病因素（女性）
盆腔炎： 女性盆腔炎患者早晨起来可能会有腰酸疼的感觉，同时还可能伴有下腹部坠胀、疼痛，白带增多等症状。尤其是在劳累、经期前后症状可能会加重。子宫内膜异位症： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位就是子宫内膜异位症，患者可能会出现晨起腰酸疼，还可能伴有痛经、月经不调等症状，疼痛多在月经期间明显，且会随着病情加重而逐渐加剧。