肝癌的肿瘤标志物主要有甲胎蛋白（AFP）、异常凝血酶原（PIVKA - Ⅱ）和糖类抗原19 - 9（CA19 - 9）等。其中甲胎蛋白是较为常用的肝癌肿瘤标志物，大约70%的肝癌患者血清中甲胎蛋白会升高，一般当血清甲胎蛋白含量大于400μg/L时，对肝癌有较高的诊断价值。
甲胎蛋白（AFP）：
作为诊断指标：甲胎蛋白主要由胎儿肝细胞及卵黄囊合成。在成人，当发生肝癌时，肝细胞又恢复了产生这种蛋白质的功能，而且随着病情恶化它在血清中的含量会急剧增加。临床上，甲胎蛋白常作为原发性肝癌的血清标志物，用于肝癌的诊断、疗效监测及预后评估等。例如，在一些肝癌高危人群（如乙肝、丙肝患者等）的定期筛查中，甲胎蛋白联合超声检查是常用的监测手段。局限性：不过，甲胎蛋白升高并不一定就是肝癌，像生殖腺胚胎瘤、少数肝炎和肝硬化患者血清中甲胎蛋白也会升高，但一般升高幅度较低，且动态观察甲胎蛋白的变化更有意义。
异常凝血酶原（PIVKA - Ⅱ）：
检测意义：异常凝血酶原也是诊断肝癌的重要肿瘤标志物。在维生素K缺乏或拮抗剂存在时，肝脏无法合成正常的凝血酶原，而会产生异常凝血酶原。原发性肝癌细胞能合成异常凝血酶原，所以检测异常凝血酶原对原发性肝癌有较高的特异性。在一些甲胎蛋白阴性的肝癌患者中，异常凝血酶原检测可能会呈阳性，有助于肝癌的早期诊断。例如，对于一些临床高度怀疑肝癌但甲胎蛋白正常的患者，检测异常凝血酶原可以提供更多的诊断信息。与其他指标联合：临床上常将异常凝血酶原与甲胎蛋白联合检测，以提高肝癌诊断的准确性。
糖类抗原19 - 9（CA19 - 9）：
相关情况：糖类抗原19 - 9是一种黏蛋白型的糖类蛋白肿瘤标志物，在胰腺癌、肝胆系癌中可显著升高。在肝癌患者中，也有部分患者的CA19 - 9会升高。不过，CA19 - 9升高还可见于其他消化系统疾病，如胰腺炎、胆囊炎、胆汁淤积性胆管炎等。所以，CA19 - 9在肝癌诊断中可作为辅助指标，当它升高时需要结合临床其他检查综合判断是否为肝癌。例如，肝癌患者如果同时伴有CA19 - 9明显升高，需要进一步排查是否合并有胆道系统的相关问题等。此外，还有其他一些肿瘤标志物在肝癌的诊断中也有一定的参考价值，如α - L - 岩藻糖苷酶（AFU）等，但上述几种是比较常用且重要的肝癌肿瘤标志物。在临床实际工作中，通常会联合多种肿瘤标志物以及影像学检查等综合判断是否患有肝癌，以提高诊断的准确性。