卵巢多囊主要是由多种因素共同作用引起的，其中遗传因素占一定比重，约20%~60%的卵巢多囊患者有家族聚集性。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有卵巢多囊，那么个体患病的风险会增加。研究发现，遗传基因的突变可能影响内分泌调节相关的通路，使得身体更容易出现卵巢多囊的病理改变。比如某些与激素合成、代谢相关的基因发生变异，就可能干扰卵巢的正常功能，导致卵巢多囊的发生。
内分泌紊乱作祟
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）以及垂体分泌的促黄体生成素（LH）和促卵泡生成素（FSH）比例失调是重要因素。正常情况下，LH与FSH的比例相对稳定，而在卵巢多囊患者中，往往出现LH水平升高，FSH水平相对正常或偏低的情况，这会影响卵巢的排卵功能，导致卵泡发育异常，多个小卵泡难以成熟排卵，进而形成卵巢多囊样改变。胰岛素抵抗相关： 约50%的卵巢多囊患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗会使身体分泌更多的胰岛素，而高胰岛素血症又会刺激卵巢间质细胞分泌过多雄激素，雄激素增多会进一步抑制卵泡发育，影响排卵，同时还会导致月经紊乱等一系列症状，促进卵巢多囊的形成。
生活方式的影响
饮食不规律与肥胖： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，加上运动量不足，容易导致体重增加，尤其是中心性肥胖。肥胖会改变激素代谢，加重胰岛素抵抗，从而增加卵巢多囊的发病风险。一般来说，体重指数（BMI）超过25的人群，患卵巢多囊的几率相对较高。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会影响神经内分泌系统的平衡。身体会分泌过多的皮质醇等应激激素，干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能，使得激素分泌紊乱，增加卵巢多囊的发生可能性。比如长期熬夜、工作学习压力过大的人群，患病风险可能会上升。