孩子长不高的原因有多种。比如遗传因素，如果父母身高偏矮，孩子遗传矮身材的可能性较大，据统计约70%的身高受遗传影响。
遗传因素：
家族遗传倾向： 如果家族中普遍身高不高，孩子很可能受到遗传基因的影响而长不高。比如父母双方都是矮个子，孩子身高低于同年龄段正常儿童平均身高的概率会增加。基因决定生长潜力： 基因会决定孩子的生长发育速度和最终身高的潜力范围，若基因中没有促使身高大幅增长的相关序列，孩子的身高增长可能受限。
营养因素：
营养摄入不足： 孩子在生长发育阶段需要充足的营养，如蛋白质、钙、维生素D等。如果孩子长期挑食、偏食，就会导致营养摄入不均衡。例如，蛋白质是骨骼生长的重要原料，长期缺乏蛋白质会影响骨骼的发育；钙是骨骼的主要成分，缺乏钙会使骨骼发育不良，影响身高增长。一般3 - 12岁儿童每天需要摄入约600 - 800毫克的钙，若摄入不足就可能影响身高。营养过剩： 相反，如果孩子营养过剩导致肥胖，也可能影响身高。因为肥胖可能会导致内分泌紊乱，影响生长激素的分泌，从而阻碍身高增长。
疾病因素：
内分泌疾病： 生长激素缺乏症是常见的导致孩子长不高的内分泌疾病。生长激素能促进骨骼、内脏和全身生长，缺乏生长激素会使孩子生长缓慢，身高明显低于同龄人。还有甲状腺功能减退症，甲状腺激素能促进机体生长发育，甲状腺功能减退时，孩子的生长发育会受到抑制，出现身高增长迟缓的情况。慢性疾病： 一些慢性疾病也会影响孩子身高，如先天性心脏病、慢性肾病等。慢性疾病会消耗孩子的身体能量，影响营养的吸收和利用，进而阻碍身高增长。例如，患有慢性肾病的孩子，由于肾脏功能受损，会影响体内激素的代谢和营养物质的排泄，导致生长发育迟缓。