孩子长不高的原因有多种。一般来说，遗传因素是重要原因之一，如果父母身高偏矮，孩子遗传矮身材的概率会增加，据统计，约70%的身高变异由遗传决定。
遗传因素影响
基因决定基础身高：孩子的身高有很大一部分由父母的基因决定，父母双方的身高情况会通过基因传递给孩子，比如父母平均身高较矮，孩子成年后的身高通常也会在相对较矮的范围内。遗传潜力受限：即使有遗传倾向，如果孩子在成长过程中其他因素不佳，也可能无法完全发挥遗传赋予的身高潜力。
营养因素影响
营养摄入不足：如果孩子饮食中蛋白质、钙、磷等营养素缺乏，会影响骨骼的生长发育。例如，钙是骨骼的重要组成成分，儿童每日需要摄入足够的钙来保证骨骼正常生长，一般1 - 10岁儿童每天需要摄入800 - 1000毫克钙，如果长期达不到这个量，就可能影响长高。营养不均衡：孩子如果挑食、偏食，只爱吃零食不爱吃正餐，会导致各种营养素摄入不均衡，影响生长激素分泌和骨骼发育。
疾病因素影响
内分泌疾病：像生长激素缺乏症，会使孩子体内生长激素分泌不足，从而影响身高增长。甲状腺功能减退症也会影响孩子的生长发育，导致身高增长缓慢。慢性疾病：如先天性心脏病、慢性肾病等慢性疾病，会影响孩子的营养吸收和身体代谢，进而阻碍身高增长。例如患有慢性肾病的孩子，由于疾病影响，身体状况较差，会限制身高的正常发育。
生活方式因素影响
睡眠不足：儿童和青少年时期是生长激素分泌的高峰期，而生长激素在睡眠时分泌旺盛。如果孩子长期睡眠不足，比如每天睡眠时间少于8 - 10小时（不同年龄有差异），会影响生长激素分泌，从而影响身高增长。缺乏运动：适当的运动可以刺激骨骼生长，促进生长激素分泌。如果孩子长期缺乏运动，比如每天户外活动时间少于1 - 2小时，会不利于骨骼的发育和身高增长。