三个月宝宝干咳，可能是以下原因引起：
1.上呼吸道感染：宝宝的呼吸道比较狭窄，容易受到感染。上呼吸道感染、鼻炎、咽炎等都可能导致宝宝干咳。
2.过敏：宝宝对某些物质过敏，如花粉、尘螨、动物毛发等，也可能引起干咳。
3.干燥环境：空气干燥、通风不良等环境因素，可能刺激宝宝的呼吸道，引起干咳。
4.胃食管反流：宝宝的胃容量较小，容易发生胃食管反流，胃酸反流到食管和喉部，可能引起刺激性干咳。
5.气道异物：如果宝宝不小心吸入异物，也可能导致干咳。
6.百日咳：百日咳是一种由百日咳杆菌引起的呼吸道传染病，宝宝可能出现阵发性、痉挛性咳嗽，伴有鸡鸣样吸气吼声。
7.其他：一些先天性疾病，如气管食管瘘、先天性喉喘鸣等，也可能导致宝宝干咳。
如果宝宝干咳持续时间较长或伴有其他症状，如发热、喘息、呼吸急促等，建议及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。同时，保持宝宝的呼吸道湿润，避免空气干燥，也有助于缓解干咳症状。