肛周湿疹可以使用糖皮质激素类药物、钙调磷酸酶抑制剂等药物治疗。一般来说，外用糖皮质激素是治疗肛周湿疹常用的方法之一。
外用糖皮质激素药物
弱效糖皮质激素： 如氢化可的松软膏，适用于婴幼儿肛周湿疹或皮肤薄嫩部位。它具有抗炎、抗过敏的作用，能减轻湿疹引起的红肿、瘙痒等症状。通常每日外用 2 - 3 次，用药时间一般不建议超过 2 周，以免引起皮肤萎缩等不良反应。中效糖皮质激素： 像泼尼松龙软膏等。中效激素抗炎作用较强，可用于病情稍重的肛周湿疹。使用时同样每日外用 2 次左右，连续使用时间一般控制在 1 - 2 周，使用过程中要注意观察皮肤变化，若出现皮肤变薄、色素沉着等情况应及时停药。
钙调磷酸酶抑制剂
他克莫司软膏： 不属于糖皮质激素，适用于成人肛周湿疹。它通过抑制钙调磷酸酶的活性，减少炎症介质的释放来发挥作用。使用时通常每日外用 2 次，一般连续使用数周是安全的，但在用药初期可能会有局部轻微的灼热感等不适，多数人可耐受。吡美莫司乳膏： 也是钙调磷酸酶抑制剂，同样适用于成人肛周湿疹。用法为每日外用 2 次，其局部刺激相对他克莫司软膏较轻，安全性较好，使用过程中也要注意观察局部皮肤反应。
抗组胺药物
口服抗组胺药： 对于瘙痒剧烈的肛周湿疹患者，可口服抗组胺药物来缓解症状。如氯雷他定，一般成人每日口服 1 次，每次 10mg；西替利嗪也是常用的，成人通常每日口服 1 次，每次 10mg。这些药物可能会引起嗜睡等不良反应，所以用药期间不宜驾驶车辆、操作机械等。儿童使用抗组胺药需在医生指导下，根据年龄和体重调整剂量。
中药外洗药物
复方黄柏液涂剂： 可用于肛周湿疹的外洗。它具有清热解毒、消肿祛腐的作用，使用时用纱布浸透药液后湿敷于患处，每次湿敷 15 - 20 分钟，每日可湿敷 2 - 3 次。使用前要注意保持肛周皮肤清洁干燥，湿敷后要注意局部皮肤的护理。苦参汤： 由苦参、蛇床子、白芷、金银花、菊花、黄柏、地肤子、大菖蒲等中药组成，具有清热燥湿、杀虫止痒的功效。一般是将中药煎煮后，待药液温度适宜时进行肛周熏洗，每次熏洗 20 - 30 分钟，每日可熏洗 1 - 2 次。中药外洗时要注意药物的温度，避免烫伤皮肤。