营养性巨幼红细胞性贫血主要是体内缺乏维生素B₁₂或叶酸引起的。一般来说，这种贫血与营养摄入不足等因素密切相关。
一、维生素B₁₂缺乏的原因
摄入不足： 婴幼儿时期，如果喂养不当，比如长期单纯母乳喂养，而母亲饮食中维生素B₁₂摄入不足，就可能导致婴儿维生素B₁₂摄入不够。像一些长期素食的人群，若饮食中不注意补充富含维生素B₁₂的食物，也容易缺乏。富含维生素B₁₂的食物主要有肉类、蛋类、乳制品等。吸收障碍： 一些胃肠道疾病会影响维生素B₁₂的吸收，比如恶性贫血患者，其胃黏膜壁细胞分泌的内因子缺乏，内因子是帮助维生素B₁₂吸收的重要物质，没有内因子，维生素B₁₂就无法正常吸收。还有小肠疾病，如小肠切除过多、克罗恩病等，也会影响维生素B₁₂在肠道的吸收。
二、叶酸缺乏的原因
摄入不足： 孕妇如果在孕期叶酸摄入不足，可能会导致胎儿或自身出现叶酸缺乏。另外，一些长期酗酒的人，酒精会干扰叶酸的代谢和吸收，而且酗酒者往往饮食不规律，容易造成叶酸摄入不够。富含叶酸的食物有绿叶蔬菜、豆类、全麦制品等。需要量增加： 婴幼儿生长发育迅速，对叶酸的需要量增加，如果没有及时补充足够的叶酸，就容易发生缺乏。比如早产儿，由于出生时体内叶酸储备不足，而生长发育快，对叶酸需求大，若喂养不当就易缺乏。还有一些患有溶血性贫血的患者，红细胞破坏增加，骨髓造血活跃，对叶酸的需要量增多，如果不能及时补充，也会导致叶酸缺乏。
三、其他相关因素
药物影响： 某些药物会干扰叶酸或维生素B₁₂的代谢。例如，长期服用抗癫痫药如苯妥英钠、扑米酮等，可能会影响叶酸的代谢，导致叶酸缺乏。一些抗肿瘤药物也可能干扰维生素B₁₂或叶酸的代谢过程。遗传因素： 极少数情况下，遗传因素也可能导致体内维生素B₁₂或叶酸代谢出现问题，从而引发营养性巨幼红细胞性贫血，但这种情况相对比较罕见。